Museets indgang ligger i Tøjhusgade 3, 1214 København K. Man kan fra Søren Kierkegaards Plads gå gennem bibliotekshaven eller gennem Tøjhusgården.

Offentlig transport

Nærmeste station er Københavns Hovedbanegård. Det tager ca. et kvarter at gå fra Hovedbanegården til Tøjhusmuseet.
 

Buslinier

Til Christiansborg: 15, 26, 29, 1A, 2A, 65E.
Til Børsen: 19, 47, 66, 2A.
Til Det kgl. Bibliotek: Havnebusserne 901 og 902, i den centrale del af havnen, sejler fra Nordre Toldbod ved Kastellet ca. tre kilometer sydpå til Det kgl. Bibliotek. Undervejs stopper havnebussen på Holmen, ved Operaen, ved Nyhavn og ved Knippelsbro.
 

Parkering

Parkering er tilladt i dele af Tøjhusgade samt på Frederiksholms Kanal.